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黄瓜农艺性状和驯化的遗传变异
作者：迈其生物
来源：BioArt植物
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黄瓜是重要蔬菜作物，也是研究植物性别决定和维管束生物学的重要模式系统。黄瓜基因组参考序列和种质资源全基因组遗传变异研究推动了重要农艺性状基因的鉴定和利用，然而，大量重要农艺性状是由较长DNA序列片段的结构变异控制，且结构变异为野生资源利用和基因挖掘带来诸多障碍，因此需要通过泛基因组研究全面鉴定黄瓜基因组的结构变异，进而促进黄瓜驯化和重要农艺性状相关基因的研究。
2022年2月3日，青岛农业大学园艺学院张忠华教授团队在Nature Communications在线发表了题为Graph-based pan-genome reveals structural and sequence variations related to agronomic traits and domestication in cucumber的研究论文。该研究首次构建了高质量的黄瓜图形结构泛基因组，阐明了黄瓜驯化过程中基因组染色体核型的演化规律，鉴定了多个与黄瓜农艺性状和驯化相关的重要结构变异，并揭示了重要性状在驯化和育种改良过程中演化的基因组学基础，这为黄瓜重要基因挖掘、野生基因资源利用和分子设计育种提供了重要信息。
